A Reitoria é o órgão executivo da Universidade que administra todas as atividades universitárias. É composta pelos cargos de reitor e vice-reitor, que são democraticamente eleitos pela comunidade universitária, pela equipe do gabinete e pelos demais órgãos vinculados.
Reitora
Profª. Drª. Andrea Name Colado Simão
Farmacêutica-bioquímica, mestre e doutora pela UEL, Andréa Name Colado Simão é docente da Universidade desde 2006 e pertence ao Departamento de Patologia, Análises Clínicas e Toxicológicas (PAC), do Centro de Ciências da Saúde (CCS). A reitora acumula vasta experiência no ensino, pesquisa e extensão. Foi coordenadora da Residência e da especialização em Análises Clínicas, chefe do PAC, coordenadora do Programa de Pós-Graduação em Fisiopatologia Clínica e Laboratorial, editora-chefe da revista científica Semina: Ciências Biológicas e da Saúde. Foi diretora do CCS de 2022 a 2026.